Juke That versteht ein paar Kommandozeilen-Optionen. Bei der Installation werden allerdings für die meisten bereits Verknüpfungen angelegt.

Die Parameter sind im Einzelnen:

/jukebox
startet Juke That bereits in der Jukebox. Diese Option ist praktisch, wenn man sie in den Autostart eines Windows-Benutzers legt, der kein Passwort hat und der einzige Benutzer des Systems ist. In diesem Fall startet die Jukebox automatisch beim Starten des Computers, ohne irgendeinen Tastendruck.
/jukebox /paused
startet Juke That in der Jukebox, aber auf Pause.
/library
startet Juke That in der Bibliotheksverwaltung.
/config DIR
stellt ein alternatives Konfigurations- und Bibliotheksverzeichnis ein, falls auf dem Computer mehrere parallele Bibliotheken verwaltet werden sollen. "DIR" ist dabei das Verzeichnis.
/stick
durchsucht Memory-Sticks und angeschlossene Festplatten nach einer Jukebox auf einem Stick.
/log info
schaltet Logging ein. Die Log-Datei liegt im "JukeThat"-Verzeichnis unter "Programme".
/log debug
schaltet erweitertes Logging ein.

Viele der Optionen sind miteinander kombinierbar. Die Reihenfolge ist dabei egal.